Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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