Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIP13Q15645 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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