Protein–RNA interactions for Protein: Q15582

TGFBI, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBIQ15582 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TGFBIQ15582 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBIQ15582 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms