Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CDSNQ15517 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CDSNQ15517 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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