Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHBQ15464 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SHBQ15464 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SHBQ15464 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms