Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUM3Q15397 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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