Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDK5R1Q15078 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CDK5R1Q15078 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDK5R1Q15078 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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