Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms