Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
R3HDM1Q15032 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
R3HDM1Q15032 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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