Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC10A1Q14973 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC10A1Q14973 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms