Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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