Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK13Q14004 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms