Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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