Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TUBA3CQ13748 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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