Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms