Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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CDH18Q13634 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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CDH18Q13634 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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