Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CUL4AQ13619 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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