Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HDAC1Q13547 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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