Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLAMF1Q13291 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms