Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTGDRQ13258 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTGDRQ13258 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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