Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF6Q13247 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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