Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MKRN3Q13064 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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