Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FOXD4Q12950 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD4Q12950 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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