Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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