Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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