Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBRQ0VD83 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms