Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNA1Q09470 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms