Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms