Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITIH3Q06033 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms