Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DSC2Q02487 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms