Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC6A3Q01959 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms