Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB1P82279 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms