Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms