Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NLRP12P59046 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms