Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms