Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCBP4P57723 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms