Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVDP53602 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MVDP53602 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MVDP53602 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MVDP53602 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MVDP53602 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms