Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA4P51532 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms