Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms