Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms