Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms