Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRIA4P48058 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms