Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IQGAP1P46940 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IQGAP1P46940 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms