Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCAMP43121 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCAMP43121 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MCAMP43121 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCAMP43121 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCAMP43121 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCAMP43121 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms