Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP2P42575 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASP2P42575 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CASP2P42575 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms