Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MMP12P39900 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MMP12P39900 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms