Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5C1P36542 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms