Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA10P31260 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms