Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTGFP29279 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTGFP29279 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTGFP29279 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms