Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD38P28907 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD38P28907 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD38P28907 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD38P28907 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD38P28907 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD38P28907 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD38P28907 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms